موج جدید بازگشت مهاجرین از پاکستان، پیامدهای انسانی، اقتصادی و اجتماعی فراوانی داشته و حکومت سرپرست را با چالش‌های بزرگی در مسیر ساماندهی این بازگشت‌ها رو رو کرده است. گفته می شود از آغاز روند اخراج مهاجران افغان از پاکستان از سال دوهزاروبیست سه، بیش از هشتصد و پنجاه هزار مهاجر افغان از پاکستان اخراج شده اند.